Perkhidmatan Kesihatan yang disediakan di Hospital Labuan kini adalah seperti berikut:

Unit Perubatan

1. Perubatan Am
1. Nefrologi Respiratori
2. Neurologi
3. Hematologi
4. Gastroanterologi

Unit Psikiatri

Unit Pembedahan

1. Pembedahan Am
   1. Pembedahan Plastik
   2. Pembedahan Pediatrik
   3. Breast and Endocrine
2. Ortopedik
3. Otorinolaringologi
4. Oftalmologi
5. Anestesiologi
6. Kecemasan & Trauma

Unit Wanita & Kanak-kanak

1. Obstetrik & Ginekologi

Unit Pediatrik

1. Pediatrik Neurologi
2. Pediatrik Kardiologi
3. Pediatrik Nefrologi

Unit Sokongan Klinikal

1. Farmasi
2. Dietetik & Sajian
3. Rekod Perubatan
4. Fisioterapi
5. Pemulihan Cara Kerja
6. Kerja Sosial Perubatan
7. Psikologi
8. Kejururawatan
9. OSHA
10. Kawalan Infeksi
11. Inovasi
12. Penyelia Hospital

Unit Diagnostik

1. Pengimejan Diagnostik
2. Patologi

Unit Pengurusan

1. Pentadbiran
2. Sumber Manusia
3. Teknologi Maklumat
4. Kewangan dan Hasil
5. Kejuruteraan
6. Keselamatan
7. Aset dan Stor
8. Pembangunan